As Bacias Hidrográficas do Rio Cubatão, do Rio da Madre e bacias contíguas situa-se na Região Hidrográfica Litoral Centro do Estado de Santa Catarina – RH8, e é a segunda em extensão na região, apresentando uma área territorial de 738 km quadrados. A área de atuação do Comitê Cubatão e Madre, situado na Região Hidrográfica 08, Litoral Centro, é formada pelas bacias hidrográficas do Rio Cubatão, do Rio da Madre e pelas demais bacias hidrográficas com exutórios no Oceano Atlântico, localizados entre as seguintes coordenadas: 736993 E, 6947799 N e 732142 E, 6888848 N no Sistema de Projeção UTM, Fuso 22 Sul, Sistema de Referência SIRGAS 2000.
Esta é a região com maior densidade demográfica do Estado e as principais atividades econômicas são representadas por pequenas e médias industrias, pelo turismo, pela produção de hortaliças em determinadas áreas e pela pesca. Com respeito a qualidade dos Recursos Hídricos, todos os rios da região apresentam alguma intensidade de poluição, principalmente por despejo de esgoto domiciliar e hospitalar, resíduos domésticos, agrotóxicos, efluentes industriais e acúmulo de sedimentos de solo, sendo está Bacia a mais vulnerável por ser o principal manancial da Grande Florianópolis, abastecendo uma população de aproximadamente 800 mil habitantes.
O atual desenvolvimento urbano e econômico regional acelerado, somados à falta de investimentos na infraestrutura urbana, tem ocasionado problemas e conflitos relacionados aos usos múltiplos de seus recursos hídricos. Destaca-se assim, a necessidade de gerenciamento local destes recursos e a importância da continuidade de atuação do Comitê Cubatão e Madre dentro deste processo de gestão, conforme preconizado na Política Nacional e Estadual de Recursos Hídricos (Lei Nº 9.433/97 e Lei Nº 15.249/2010).