Atualmente o Comitê Chapecó e Irani conta com três Câmaras Técnicas instituídas e atuantes:
- Câmara Técnica Permanente para atuação do Comitê em situações de crise hídrica na Bacia Hidrográfica do Rio Chapecó e Irani. (Resolução 02/2020).
- Câmara Técnica Permanente para atuação do Comitê em apoio à criação do Comitê Rio Uruguai (Resolução 03/2020).
- Câmara Técnica permanente para tratar de assuntos relacionados à empreendimentos do setor hidrelétrico na Região Hidrográfica 02 de Santa Catarina (Resolução 14/2021).
