A Bacia Hidrográfica do Rio Tubarão, do Complexo Lagunar e bacias contíguas é composta por 26 municípios, dos quais 22 municípios estão inseridos na área de atuação do Comitê de Gerenciamento da Bacia Hidrográfica do Rio Tubarão, do Complexo Lagunar e Bacias Contíguas, são eles: Lauro Müller, Orleans, São Ludgero, Braço do Norte, Grão Pará, Rio Fortuna, Santa Rosa de Lima, Anitápolis, São Bonifácio, São Martinho, Armazém, Gravatal, Capivari de Baixo, Tubarão, Pedras Grandes, Treze de Maio, Jaguaruna, Sangão, Imaruí, Imbituba, Pescaria Brava e Laguna.